Le microbiote intestinal : notre « deuxième cerveau » ?

Notre intestin abrite des dizaines de milliers de milliards de micro-organismes : bactéries surtout, mais aussi virus, champignons et archées. Cet écosystème, le microbiote intestinal, est devenu l'un des domaines de recherche les plus actifs de la biologie.

Qu'est-ce que le microbiote ?

Chaque personne a un microbiote unique, façonné dès la naissance (mode d'accouchement, allaitement), puis par l'alimentation, l'environnement et les médicaments. Il compte des centaines d'espèces bactériennes différentes chez chaque individu.

Ses rôles connus

Rôle	Exemple
Digestion	Fermentation des fibres que nous ne savons pas digérer
Production de molécules	Acides gras à chaîne courte, certaines vitamines
Immunité	Éducation du système immunitaire, barrière contre les pathogènes
Barrière intestinale	Entretien de la paroi de l'intestin

L'axe intestin-cerveau

L'intestin contient un vaste réseau de neurones, d'où son surnom de « deuxième cerveau ». Il communique avec le cerveau par le nerf vague, les hormones et les molécules produites par les bactéries. Des études, surtout chez l'animal, suggèrent un lien entre microbiote, stress et humeur. Chez l'humain, ces liens sont encore en cours d'exploration.

Beaucoup d'associations entre microbiote et maladies sont observées, mais établir une relation de cause à effet chez l'humain reste difficile.

Les perturbations

• Les antibiotiques réduisent temporairement la diversité du microbiote (voir notre article sur la résistance aux antibiotiques).
• Une alimentation pauvre en fibres et riche en produits ultra-transformés.
• Le stress et le manque de sommeil (voir pourquoi on dort).

Nourrir son microbiote

• Des fibres variées : légumes, fruits, légumineuses, céréales complètes.
• Des aliments fermentés : yaourt, kéfir, choucroute, kombucha.
• La diversité alimentaire, associée à un microbiote plus diversifié.

Nos voisins d'alimentation.fr font le point sur l'utilité des probiotiques, et boisson.fr explique comment préparer un kombucha maison.

La greffe de microbiote

La transplantation de microbiote fécal est utilisée en médecine pour traiter certaines infections intestinales récidivantes. D'autres applications sont à l'étude.

Questions fréquentes

Faut-il prendre des probiotiques ?

Leur intérêt dépend de la souche et de la situation. Demandez conseil à un professionnel de santé.

Peut-on analyser son microbiote ?

Des tests existent, mais leur interprétation pour la santé individuelle reste limitée.